2009年5月16日 星期六

DNA gel 與 RNA gel的差異

Run RNA gel的buffer通常是MOPS, formaldehyde是加在gel中,而且sample
在run之前要先煮過 ,至於DNA gel,一般是TAE或TBE buffer

因為單股RNA容易形成secondary structure

造成立體形狀不同->影響在gel中移動的速度

這樣跑出來的速度跟base數就不是一個比例的關係

所以用高溫denature->RNA恢復單股 formadehyde防止RNA再形成secondary structure

這樣速度才會只決定於RNA之大小